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X. Frank Zhang和Wonpil Im從最近的研究中知道,SARS-CoV-2尖峰蛋白與人體細胞中的血管緊張素轉換酶2(ACE2)受體之間的相互作用比引起2002-2004年SARS爆發的病毒SARS-CoV-1的結構相同的尖峰蛋白與相同受體之間的相互作用更強。

How-SARS-CoV-2-Spike-S-Protein-Binds-to-Human-ACE2-Receptor-scaled.jpg

"我們的目標是表征SARS-CoV-2,並研究其入侵人類細胞過程中的蛋白質-蛋白質之間的相互作用,以提供更多關於使其成功入侵過程的第一步成為可能的機制的見解,"Lehigh的生物工程和機械工程與力學副教授Zhang說。

他們的研究結果出現在3月中旬出版的《生物物理學雜志》特刊 "生物物理學傢應對COVID-19挑戰一 "中一篇名為 "SARS-CoV-2尖峰RBD與人類ACE2蛋白-蛋白相互作用的生物力學表征"的文章中。

利用單分子力譜和分子動力學模擬相結合的方法,研究團隊能夠識別出ACE2糖類(附著在蛋白質表面的糖基)和SARS-CoV-2尖峰之間以前未知的相互作用。正是這種相互作用似乎是加強病毒與細胞相互作用的原因。他們說,這可能部分解釋瞭COVID-19與造成2002-2004年SARS爆發的類似病毒相比感染率更高的原因。

"我們驚訝地發現,ACE2聚糖和SARS-CoV-2尖峰蛋白之間的特殊相互作用是使病毒與細胞分離如此困難的原因,"Im說。為瞭得出這些發現,該團隊采用瞭Zhang的創新單分子檢測技術,測量尖峰蛋白-ACE2受體相互作用的分離力。利用Im開發的CHARMM-GUI中提供的復雜系統的全原子分子動力學模擬,他們就確定瞭這個相互作用中的詳細結構信息。

"在我們小心翼翼地去除所有的ACE2聚糖並測量相互作用的力量後,我們看到SARS-CoV-2尖峰ACE2相互作用的強度回落到與SARS-CoV-1相似的水平,"張說。

"這種新發現的與ACE2聚糖的相互作用有可能是COVID-19比結構相似的SARS-CoV-1有更高的比率的原因之一,後者的相互作用較弱,"Zhang說。"我們的希望是,研究人員可能能夠利用這些信息開發新的策略來識別、預防、治療和接種COVID-19。"

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