但是，南非國傢生物多樣性研究所和馬拉維博物館的一個團隊在2016年進行的一項調查（其結果現在首次公佈）發現在幸存的幾片森林裡有這種微小的爬行動物的種群。
他們估計，自20世紀80年代以來，森林--以及變色龍的數量--已經縮減瞭80%。遺傳（DNA）分析也表明，這些動物被困在它們的森林斑塊中，無法在它們之間移動繁殖。如果沒有這種雜交，遺傳多樣性將隨著時間的推移而喪失，這對該物種的生存構成瞭另一個嚴重威脅。
這項研究發表在《Oryx-The International Journal of Conservation》上，由南非國傢生物多樣性研究所和金山大學的Krystal Tolley教授領導。
正是她在2014年的評估工作，導致世界自然保護聯盟(IUCN)將查普曼Pygmy Chameleon列入其瀕危物種紅色名錄，列為極度瀕危物種。將馬拉維山的衛星圖像與20世紀80年代拍攝的圖像相比較，發現森林損失巨大，變色龍首次被描述的地區已經完全被清除。剩下的部分已經變得支離破碎--小塊的森林，相互之間被切斷。
由於擔心變色龍可能已經滅絕， Tolley教授和其他研究人員求助於眾籌網站RocketHub，以籌集必要的資金來調查剩餘的斑塊，尋找任何幸存的種群。
變色龍愛好者們響應瞭這一呼籲，捐贈瞭5670美元，其中包括來自Scion自然科學協會的1000美元捐款，這足以讓研究人員調查馬拉維山區剩餘的兩個森林斑塊和95公裡外的米昆迪附近的一個區域，1998年，37隻變色龍被釋放到那裡，試圖保護這一物種。
隨後他們在這三個地方都發現瞭變色龍，Tolley教授描述瞭調查小組在發現該物種仍然存在時的歡欣鼓舞。
她表示：“我們發現的第一隻變色龍是在森林邊緣的過渡區，那裡有一些樹木，但大部分是玉米和木薯植物。當我們發現它時，我們起瞭一身雞皮疙瘩。我們不知道我們是否會得到更多，但是一旦我們進入森林，就會有很多，盡管我不知道這將持續多久。”
然後研究人員對從變色龍身上提取的樣本進行瞭分析，以瞭解它們的遺傳多樣性是否也已減少。雖然這並不明顯，但研究人員認為這可能是因為這種影響需要時間來顯示。
他們確實看到有證據表明，被分割的種群之間的基因流動被破壞瞭。實際上，每個森林片區現在都是一個小的、孤立的種群，無法與鄰近片區的變色龍進行繁殖。這將隨著時間的推移減少遺傳多樣性，增加整個物種的滅絕風險。
Tolley教授說：“在這個物種達到無法返回的地步之前，森林的損失需要立即關註。需要采取緊急保護行動，包括停止森林破壞和恢復棲息地以促進連接性。”
研究人員建議將剩餘的森林作為附近的Matandwe森林保護區的一部分，這樣它就可以被宣佈為關鍵生物多樣性區，並采取強有力的措施來確保其保護。他們還建議對變色龍進行更多和徹底的調查，以監測它們的數量和遺傳多樣性，並呼籲當地土地所有者參與保護Mikundi森林及其人口，作為對變色龍在馬拉維山區自然范圍的損失的一些保險。總的來說，他們說需要制定和頒佈一個全面的、有適當資金支持的行動計劃，以防止該物種的滅絕。
Tolley教授表示：“它們是小而溫和的生物。其他變色龍物種可能會發出嘶嘶聲，並且會咬人，但Pygmy變色龍很溫和，隻是很美麗。”
“特別是查普曼的變色龍是最小的變色龍之一，而且不像大多數變色龍那樣有一條卷曲的尾巴，也許是因為它們不是特別的樹棲動物，而是在森林地面的落葉層中走動，晚上爬到低矮的灌木叢中睡覺。它們直接融入落葉堆中，與枯葉的圖案完美匹配。”
"它們大部分是棕色的，但它們可以變成相當漂亮的藍色和綠色，上面佈滿小圓點，這可能是它們相互交流的一種方式。它們也會振動，當我們拿著它們的時候，我們可以感覺到它。我們真的不知道為什麼，但這也可能是某種形式的交流。它們在被我們握在手中時這樣做，可能意味著這是一種試圖嚇唬捕食者的方式。"
她補充說：“當我想到發生在它們身上的事情--我們對它們的棲息地所做的事情，我就會感到難過。它們真的隻是無助的受害者。”
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